Serotonin biogen monoaminlərə aiddir və əsas amin turşusu L-triptofandan sintez olunur. Serotonin qan plazmasında, qaraciyərdə və digər orqanlarda metabolizə olunur. Serotonin hüceyrə səthi reseptor ailəsi ilə qarşılıqlı əlaqədə olmaqla hüceyrə səviyyəsində fizioloji prosesləri tənzimləyir.
Bədəndəki serotoninin ümumi miqdarının 80-90% -i mədə-bağırsaq traktının enterokromaffin hüceyrələrində sintez olunur və saxlanılır. Az miqdarda serotonin daim enterokromaffin hüceyrələrindən mədə-bağırsaq traktının lümeninə buraxılır, burada serotonin tərəfindən aktivləşdirilmiş daxili sensor neyronlar peristaltik refleksi və ifrazı stimullaşdırır.
Mədə və bağırsağın enterokromafin hüceyrələrindən serotoninin çox hissəsi qan dövranına daxil olur və trombositlər tərəfindən udulur, bu da onu orqanizmin toxumalarına nəql edir, burada serotonin fizioloji proseslərdə, məsələn, çoxalma və regenerasiyada iştirak edir.
Serotonin mərkəzi sinir sistemində neyrotransmitter rolunu oynayır və davranış və fizioloji funksiyaların tənzimlənməsində iştirak edir. Serotonergik sistemin (ST-ergik) təsir etdiyi psixoloji və davranış prosesləri yaddaş, öyrənmə, qidalanma davranışı, yuxu rejimi, termorequlyasiya, ağrı modulyasiyası, ürək-damar funksiyası və hipofiz hormonlarının hipotalamik tənzimlənməsi daxildir.
Neyrotransmitter və toxuma hormonu funksiyalarını eyni vaxtda yerinə yetirən serotonin həm normal şəraitdə, həm də patologiyada orqanizmdə müxtəlif fizioloji proseslərin formalaşmasında və tənzimlənməsində iştirak edir, homeostazın saxlanmasında mühüm rol oynayır.